Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rrs1Q9CYH6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrs1Q9CYH6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms