Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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