Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mgme1Q9CXC3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mgme1Q9CXC3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms