Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Utp23Q9CX11 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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