Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV1

Mcm8, DNA helicase MCM8, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcm8Q9CWV1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mcm8Q9CWV1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mcm8Q9CWV1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms