Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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