Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms