Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms