Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms