Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930553M12RikQ9CUH1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms