Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms