Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms