Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms