Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR35

Ctrb1, Chymotrypsinogen B, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctrb1Q9CR35 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ctrb1Q9CR35 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ctrb1Q9CR35 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ctrb1Q9CR35 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ctrb1Q9CR35 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ctrb1Q9CR35 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctrb1Q9CR35 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ctrb1Q9CR35 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ctrb1Q9CR35 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctrb1Q9CR35 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ctrb1Q9CR35 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ctrb1Q9CR35 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ctrb1Q9CR35 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ctrb1Q9CR35 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctrb1Q9CR35 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctrb1Q9CR35 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctrb1Q9CR35 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ctrb1Q9CR35 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ctrb1Q9CR35 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctrb1Q9CR35 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ctrb1Q9CR35 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctrb1Q9CR35 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctrb1Q9CR35 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctrb1Q9CR35 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctrb1Q9CR35 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctrb1Q9CR35 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctrb1Q9CR35 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctrb1Q9CR35 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctrb1Q9CR35 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctrb1Q9CR35 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctrb1Q9CR35 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctrb1Q9CR35 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctrb1Q9CR35 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms