Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc2Q9CQP2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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