Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM5

Txndc17, Thioredoxin domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc17Q9CQM5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Txndc17Q9CQM5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Txndc17Q9CQM5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Txndc17Q9CQM5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Txndc17Q9CQM5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Txndc17Q9CQM5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Txndc17Q9CQM5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Txndc17Q9CQM5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Txndc17Q9CQM5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Txndc17Q9CQM5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Txndc17Q9CQM5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Txndc17Q9CQM5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Txndc17Q9CQM5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Txndc17Q9CQM5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Txndc17Q9CQM5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Txndc17Q9CQM5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Txndc17Q9CQM5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Txndc17Q9CQM5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Txndc17Q9CQM5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc17Q9CQM5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms