Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms