Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms