Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl39lQ9CQD0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms