Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms