Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms