Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
1700129C05RikQ9CQ77 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms