Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms