Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPY3

Cdca5, Sororin, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca5Q9CPY3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca5Q9CPY3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms