Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms