Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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