Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Krt88Q9CPR6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms