Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2a1Q99PM3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms