Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc4Q99PH1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms