Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim3Q99PE5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms