Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rassf3Q99P51 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rassf3Q99P51 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms