Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsnaxip1Q99P25 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms