Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms