Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB5

Gsdmc, Gasdermin-C, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsdmcQ99NB5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GsdmcQ99NB5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GsdmcQ99NB5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GsdmcQ99NB5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GsdmcQ99NB5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GsdmcQ99NB5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GsdmcQ99NB5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GsdmcQ99NB5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GsdmcQ99NB5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms