Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms