Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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