Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a9Q99MR3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc12a9Q99MR3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc12a9Q99MR3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc12a9Q99MR3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc12a9Q99MR3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc12a9Q99MR3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a9Q99MR3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a9Q99MR3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a9Q99MR3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a9Q99MR3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a9Q99MR3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a9Q99MR3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a9Q99MR3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a9Q99MR3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a9Q99MR3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a9Q99MR3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a9Q99MR3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms