Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkd1Q99MH6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms