Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gins4Q99LZ3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms