Protein–RNA interactions for Protein: Q99LS3

Psph, Phosphoserine phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsphQ99LS3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PsphQ99LS3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PsphQ99LS3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PsphQ99LS3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PsphQ99LS3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PsphQ99LS3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PsphQ99LS3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PsphQ99LS3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PsphQ99LS3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PsphQ99LS3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PsphQ99LS3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PsphQ99LS3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PsphQ99LS3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PsphQ99LS3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PsphQ99LS3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PsphQ99LS3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PsphQ99LS3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms