Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rcbtb2Q99LJ7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms