Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ2

Abtb1, Ankyrin repeat and BTB/POZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abtb1Q99LJ2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abtb1Q99LJ2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms