Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms