Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lactb2Q99KR3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lactb2Q99KR3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lactb2Q99KR3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lactb2Q99KR3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lactb2Q99KR3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lactb2Q99KR3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lactb2Q99KR3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lactb2Q99KR3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lactb2Q99KR3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lactb2Q99KR3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lactb2Q99KR3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lactb2Q99KR3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lactb2Q99KR3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lactb2Q99KR3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lactb2Q99KR3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lactb2Q99KR3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lactb2Q99KR3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms