Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms