Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep3Q99KK1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep3Q99KK1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms