Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms