Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdelr1Q99JH8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms