Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms