Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms